切换至 "中华医学电子期刊资源库"

中华诊断学电子杂志 ›› 2015, Vol. 03 ›› Issue (04) : 296 -299. doi: 10.3877/cma.j.issn.2095-655X.2015.04.019

所属专题: 文献

基础研究

细菌16S核糖体RNA基因检测杰氏棒状杆菌一株
崔颖鹏1,(), 黄朱亮1   
  1. 1. 510080 广州,中山大学附属第一医院医学检验科
  • 收稿日期:2015-07-19 出版日期:2015-11-26
  • 通信作者: 崔颖鹏

Identification of corynebacterium jeikeium by detection of bacterial 16s ribosomal RNA gene

Yingpeng Cui1,(), Zhuliang Huang1   

  1. 1. Department of Clinical Lboratory, the First Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University, Guangzhou 510080, China
  • Received:2015-07-19 Published:2015-11-26
  • Corresponding author: Yingpeng Cui
  • About author:
    Corresponding author: Cui Yingpeng, Email:
引用本文:

崔颖鹏, 黄朱亮. 细菌16S核糖体RNA基因检测杰氏棒状杆菌一株[J]. 中华诊断学电子杂志, 2015, 03(04): 296-299.

Yingpeng Cui, Zhuliang Huang. Identification of corynebacterium jeikeium by detection of bacterial 16s ribosomal RNA gene[J]. Chinese Journal of Diagnostics(Electronic Edition), 2015, 03(04): 296-299.

目的

探讨通过16S核糖体RNA(16S rRNA )基因测序的方法用于临床菌株鉴定。

方法

以细菌16S rRNA基因为靶序列,采用细菌的通用引物P1、P2进行PCR扩增,同时送到测序公司测序从而达到鉴定。

结果

待测菌株及ATCC25923阳性对照通过PCR得到的扩增片段为1 465bp左右,待测菌株经测序比对鉴定为一株杰氏棒状杆菌,阳性质控ATCC25923鉴定为一株金黄的葡萄球菌,阴性对照未出现任何结果。

结论

通过PCR检测细菌16srRNA基因可以应用于临床菌株的鉴定,并且适用一些难以鉴定的细菌。

Objective

To detect clinical strain by amplifying 16S ribosomal RNA(16S rRNA) gene with polymerase chain reaction (PCR) method.

Methods

16S rRNA gene was amplifyied by universal primers P1, P2 with polymerase chain reaction, and the polymerase chain reaction products were sequenced to achieve the DNA sequences.

Results

PCR products were about 1 465bp, and the PCR sequences were blasted in NCBI web to achieve the proper strain name, with the use of this method, the unkown gram-positive bacilli strain was identified as corynebacterium jeikeium strain, ATCC25923 was identified as a strain of staphylococcus aureus and negative control was also specific.

Conclusion

16S rRNA gene detection can be used as strain identification, and especially for some less common clinical strains.

表1 聚合酶链反应用的引物
表2 聚合酶链反应体系试剂
图1 临床分离菌株基因组DNA扩增产物电泳图
图2 ATCC25923聚合酶链反应扩增产物电泳图
[1]
雷正瑜.16S rDNA序列分析技术在微生物分类鉴定做的应用. 湖北生态工程职业技术学院学报[J].2006, 4(1): 4-7.
[2]
杨霞,陈陆,王川庆.16S rRNA基因序列分析技术在细菌分类中应用的研究进展[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2008, 36(2): 55-60.
[3]
卫俊杰,刘华,赵有成. 应用PCR方法检测重症合并感染病人血中细菌16SrRNA基因的临床价值[J]. 云南医药, 2008, 29(5): 447-449.
[4]
陈东科,孙长贵,魏莲花, 等. 实用临床微生物学检验与图谱[M].1版. 北京: 人民卫生出版社, 2011: 242-254.
[5]
胡晓红,彭惠民,刘昕, 等. PCR及Real-time PCR评价细菌DNA提取方法[J]. 重庆医科大学学报, 2008, 33(2): 155-158.
[6]
金中淦,葛平,徐蓉, 等.16S rRNA、16S-23S rRNA基因测序分析检测主要血流感染病原菌比较[J]. 分子诊断与治疗杂志, 2012, 4(3): 181-185.
[7]
鲁辛辛,黄艳飞,田晓波. 细菌rDNA分类鉴定的方法学研究[J]. 中华检验医学杂志, 2006, 29(5): 435-437.
[1] 葛飞霞, 蒋银, 杨丹. 酶联免疫吸附测定法与PCR仪检测在乙型肝炎诊断中的临床应用[J]. 中华危重症医学杂志(电子版), 2023, 16(04): 310-315.
[2] 孙国先, 徐媛, 刘微丽, 郑庆斌, 侯红玲. 辛普森菌群多样性指数与降钙素原对机械通气细菌性肺炎患者的预测价值研究[J]. 中华危重症医学杂志(电子版), 2023, 16(01): 28-32.
[3] 魏权, 张燊, 陈慧佳, 邹姮, 胡丽娜. 女性生殖道微生物群与辅助生殖技术相关性研究现状[J]. 中华妇幼临床医学杂志(电子版), 2023, 19(02): 151-155.
[4] 王锃涛, 王宪波, 曹钰, 郝禹, 韩俊燕, 曾辉. 基于多色流式降维聚类方法的自发性细菌性腹膜炎患者T淋巴细胞亚群分析[J]. 中华实验和临床感染病杂志(电子版), 2023, 17(02): 92-101.
[5] 邓欣怡, 曾振宇, 李晓岚. 细菌群体感应信号对宿主免疫调节机制的研究进展[J]. 中华口腔医学研究杂志(电子版), 2023, 17(02): 140-147.
[6] 罗来邦, 王绪杨, 胡续光, 张友福, 徐志丹. 宏基因组二代测序早期筛查肝移植术后人类微小病毒B19感染临床研究[J]. 中华移植杂志(电子版), 2022, 16(06): 346-352.
[7] 郭长江, 冷建刚, 邵伟. 阿莫西林克拉维酸钾联合布地奈德治疗小儿反复细菌性呼吸道感染[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2023, 16(03): 394-396.
[8] 朱伟权, 叶善平, 唐和春, 刘东宁, 鞠后琼, 仲崇晗, 黄智翔, 李太原. 机器人辅助直肠癌NOSES术后细菌学及肿瘤学结果的前瞻性研究[J]. 中华结直肠疾病电子杂志, 2023, 12(04): 282-287.
[9] 朱敏, 李法强. CD64指数联合降钙素原、白介素-6、血清淀粉样蛋白A检测对重型颅脑损伤术后颅内细菌感染的诊断价值[J]. 中华神经创伤外科电子杂志, 2023, 09(01): 26-31.
[10] 杨艳丽, 陈昱, 赵若辰, 杜伟, 马海娟, 许珂, 张莉芸. 系统性红斑狼疮合并血流感染的危险因素及细菌学分析[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(06): 694-699.
[11] 李秋琼, 薛静, 王敏, 陈芬, 肖美芳. NSE、SIL-2R、TNF-α检测对小儿病毒性脑膜炎与细菌性脑膜炎的诊断价值[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(03): 303-307.
[12] 王晓苏, 戴铮, 朱嘉嘉, 李启超, 张李涛. BacT/ALERT两种血培养系统8种血培养瓶对模拟菌血症标本检测能力的对比研究[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2023, 11(04): 207-213.
[13] 刘平娟, 罗科城, 吴家茵, 廖康, 胡雯雯, 陈怡丽. 神经内科重症监护室患者肠道耐碳青霉烯类肠杆菌目细菌主动筛查研究[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2023, 11(04): 235-240.
[14] 刁福强, 罗欣, 古春明, 唐玲玲. 广州某医院儿童社区获得性肺炎病原菌分布及耐药性分析[J]. 中华临床实验室管理电子杂志, 2023, 11(01): 38-44.
[15] 杨锐富, 周燕斌. 主要协同转运蛋白超家族膜转运蛋白与细菌生物膜形成的相关性研究进展[J]. 中华诊断学电子杂志, 2023, 11(02): 77-81.
阅读次数
全文


摘要